在东莞办理公司变更手续需要按照以下步骤进行。

首先，公司变更手续的第一步是准备相关文件。这包括变更申请书、股东大会决议书、董事会决议书、公司章程等。这些文件需要按照规定的格式进行填写，并加盖公司公章。

第二步是将准备好的文件提交给东莞市工商局进行备案。备案材料通常包括变更申请书、股东大会决议书、董事会决议书、公司章程等。在提交材料时，需要填写相关表格，并缴纳相关的手续费。

第三步是等待审批和批准。一般来说，东莞市工商局会在接收到文件后进行审核，审批周期时间根据具体情况而定。如果申请符合相关法律法规和政策，经审批批准后，东莞市工商局将会发放变更登记证书。

第四步是进行相关变更登记手续。根据《中华人民共和国公司法》的规定，公司变更登记需要在变更生效后30日内办理。变更登记包括将变更事项在工商部门进行备案登记，并领取新的营业执照、税务登记证等。

第五步是办理银行相关手续。公司变更完成后，需要及时通知银行进行账户变更手续，以确保公司的资金和财务管理顺利进行。

最后，变更完成后，公司还需更新相关企业信息，如在税务局进行税务登记变更、在社保局进行社会保险登记变更等。

综上所述，要在东莞办理公司变更手续，需要准备相关文件并提交给东莞市工商局备案，等待审批和批准，然后进行相关变更登记手续和银行手续，最后更新相关企业信息。这些步骤的完成将确保公司的合法变更，并保证公司的正常运营和管理。