医疗器械许可证是指国务院食品药品监督管理部门对生产、经营医疗器械的单位进行审定并颁发的凭证。在东莞，医疗器械许可证分为二类和三类，根据不同的医疗器械使用范围和危害程度进行分类，申请流程和注意事项也有所区别。

申请东莞二、三类医疗器械许可证的流程如下：

1. 登陆国家食品药品监督管理部门网站，下载《东莞市医疗器械经营企业许可证申请表》和《医疗器械经营许可证申请书》等相关材料。

2. 准备好相关证件和材料，包括企业营业执照、法人代表身份证、医疗器械经营许可证申请表、医疗器械产品注册证明等。

3. 将准备好的材料提交给东莞市食品药品监督管理局，进行初审。

4. 经过初审合格后，安排现场核查和检查。

5. 通过核查和检查后，申请人需支付相关费用。

6. 审核通过后，颁发医疗器械经营许可证。

在申请东莞二、三类医疗器械许可证时，需要注意以下事项：

1. 申请人必须是合法注册的企业或个人，具有独立法人资格。

2. 申请人必须有负责医疗器械事务的专业技术人员。

3. 所申请的医疗器械必须符合国家相关标准和法规。

4. 提交的申请材料必须真实有效，不得有虚假信息。

5. 在申请过程中，需配合相关部门的检查和核实。

通过遵循以上流程和注意事项，申请人可以顺利获得东莞二、三类医疗器械许可证，依法合规开展医疗器械经营活动，确保产品质量和使用安全。