申请东莞食品经营许可证是开设食品经营店铺的必备手续。下面是申请流程及注意事项：

申请流程：

1. 准备相关材料：包括个人身份证明、经营场所租赁合同、食品卫生安全管理人员的证书等。根据东莞市相关规定，还需要提供食品经营许可证申请书和食品经营场所图纸等。

2. 到当地食品药品监督管理部门（或者市场监督管理局）进行现场核查：需提前预约并到指定地点进行现场核查，核查完毕后会给出初步意见。

3. 缴纳相关费用：根据《东莞市食品经营许可证收费管理办法》，申请人需要根据店铺规模大小缴纳相应的费用。

4. 审核及颁发：经过审核无误后，会颁发食品经营许可证。一般情况下，整个流程需要1-2个月左右。

注意事项：

1. 提前准备材料：确保提前准备齐全相关材料，以免耽误申请进度。

2. 合规经营：开店前需与食品药品监督管理部门进行沟通，了解相关的食品安全法律法规，确保自己的经营行为合规。

3. 保持卫生：食品经营场所需要保持整洁卫生，确保食品的质量和安全。

4. 定期检查：持证经营后，定期进行食品安全相关培训和检查，确保经营行为符合法规要求。

总之，申请东莞食品经营许可证是经营食品店铺的必经之路，希望经过以上流程及注意事项的介绍，申请者能够顺利办理手续，开设一家合法合规的食品店铺。祝申请顺利！