在东莞进行公司变更需要办理以下手续：

首先，公司变更需要经过股东会或者董事会的决议，并填写《公司章程变更书》，并加盖公司公章。

其次，根据公司变更的具体内容，需要向东莞市工商行政管理局申请办理相关手续。比如，如果是公司名称的变更，需要提交《企业名称预先核准通知书》、《企业注册表》、《基本信息表》等材料，并填写《企业名称变更申请书》；如果是公司地址的变更，需要提交《企业营业执照》、新地址的租赁合同等材料，并填写《企业地址变更申请书》。

另外，如果公司股东、法定代表人、注册资本或者经营范围发生变化，也需要向工商局进行备案，办理相应手续。

除了工商局，还需要向税务局进行变更登记，办理纳税人变更手续。还有需要向人力资源和社会保障局、银行等部门进行变更登记。

总的来说，公司变更涉及多个部门，需要向各相关部门逐一申请办理手续，确保变更手续齐全、合法有效。希望公司在东莞进行变更时，能够按照规定办理相关手续，顺利完成变更程序。