东莞市二、三类医疗器械许可证是指符合中国食品药品监督管理局规定的医疗器械分类管理要求的许可证，适用于需要进行生产、销售、进口或者租赁二、三类医疗器械的单位或个人。申请这一许可证是为了保障医疗器械的安全性和有效性，保障患者和用户的权益。

一、申请流程：

1.单位或个人向东莞市食品药品监督管理局提出二、三类医疗器械许可证申请。

2.申请人提交《医疗器械经营企业申请表》及相关材料，包括但不限于医疗器械产品注册证、生产企业许可证、检验报告、产品说明书等。

3.东莞市食品药品监督管理局对提交的资料进行初审，并组织现场审核。

4.审核通过后，申请人需按照规定缴纳相关费用。

5.东莞市食品药品监督管理局对缴费情况进行核实，如符合要求则颁发二、三类医疗器械许可证。

6.申请人收到许可证后，即可开始进行医疗器械的生产、销售或进口等活动。

二、所需资料：

1.《医疗器械经营企业申请表》

2.医疗器械产品注册证

3.医疗器械产品检验报告

4.医疗器械产品说明书

5.生产企业许可证

6.法人营业执照

7.申请人的资质证明文件

8.其他相关材料

需要注意的是，申请人在提交申请材料时应当确保所有材料的真实性和完整性，如有虚假材料或者遗漏重要信息的情况将会影响申请进度。同时，申请人应当根据东莞市食品药品监督管理局的要求提前准备好相关资料，以便顺利进行许可证申请流程。

综上所述，东莞市二、三类医疗器械许可证的申请流程和所需资料是一个比较繁琐的过程，需要申请人仔细研究相关法规和规定，准备充分的申请材料，并积极配合监管部门的审核工作，以确保成功获得许可证并合法开展医疗器械相关业务。